4月9日，北京小客车指标调控管理办公室公布了2016年第二期小客车指标申请审核结果和配置情况。累计收到个人示范应用新能源小客车配置指标申请和确认延期的共11327个。
截止到2016年4月8日24:00，小客车配置指标累计收到个人普通小客车配置指标申请和确认延期的共2690457个；有43361家企事业等单位申请普通小客车配置指标70796个；累计收到个人示范应用新能源小客车配置指标申请和确认延期的共11327个；有1217家单位申请示范应用新能源小客车配置指标1616个。按照规定，有关部门将对申请信息进行审核，审核结果将于4月25日在北京缓解拥堵网站公布。
2016年第一期小客车指标配置个人示范应用新能源小客车指标12214个，申请数约占个人全年指标的四分之一。配置单位示范应用新能源小客车指标为1819个。
根据市小客车指标办此前发布的通知，2016年小客车指标年度配额为15万个，其中示范应用新能源指标额度6万个(个人5.1万个，单位3000个，营运6000个)。根据新的配置办法，今年的新能源指标向申请人直接配置，按照申请时间先后排序，如果新能源小客车指标申请人数超过6万，超过部分按照申请时间顺序轮候，在下一年度优先配置，也就是2017年优先配置。也就是说，新能源车将不再按照摇号时的整数平均分配原则，而是6万个指标发完为止，“先到先得”。按照目前的速度，本年度新能源指标在今年第四期即8月份就会全部配置完毕，想要申请新能源指标的市民只能等待明年。
北京市汽车摇号每两月举行一次，自2014年2月26日第一期新能源汽车摇号以来，共举行了十二期摇号，其中，第十一和十二期的新能源汽车申请数直接配置，2014-2015年北京共配置新能源汽车指标66587个，其中个人50861个，单位15726个。