丰田新款普锐斯提高了配备的电池的输出功率，辅助行驶时和充电时能流过更多的电流。
新款普锐斯根据车型等级使用不同的电池。最便宜的“E”、高档款“A”和“APremium”配备的是锂离子电池，标准款“S”和各级别的4轮驱动车型都配备的是镍氢电池。
使用两种电池就要求电压和电池的输出功率一致。新款普锐斯的镍氢电池较第三代普锐斯提高了输出功率，因此，锂离子电池也对“普锐斯α”采用的产品进行了重新设计。
新的镍氢电池的总电压为201.6V，载流量为6.5Ah，电池单元数量为168个。电池模块由6个电池单元组成，这一点与第三代普锐斯相同，但变更了电极，增加了充电时输入的电力和辅助行驶时可输出的电力。与原来的电池相比，输出功率增加28％，在较长的下坡等路况行驶时，能再生更多的电力。
为配合镍氢电池的输出功率，锂离子电池也提高了输出功率。对普锐斯α采用的电池变更了电极材料，同时降低了电池单元的电阻等。电压为207.2V，载流量为3.6Ah，单元数量为56个。
另外，包含继电器和电池监控单元在内的电池组的重量方面，镍氢电池为40.3kg，比原来减轻1kg，体积为35.5L，比原来削减10％，能配备在后座下方。这是通过实现继电器、电池监控单元和线束的小型化，并将原来包含在电池组中的空冷风扇安装在车身一侧实现的。锂离子电池组的重量为24.5kg，比镍氢电池的电池组轻15.8kg。